Z woli Założyciela Miasta i Fundatora kościołów oraz Kalwarii – Jakuba Wejhera – opiekę nad Sanktuarium sprawują braci mniejsi, popularnie nazywani franciszkanami.
Konwent wejherowski należy do Prowincji św. Franciszka z Asyżu.
Obecnie w Sanktuarium pracuje 9 braci.
o. DARIUSZ Rafał Szymaniak - kustosz Sanktuarium, gwardian, proboszcz
o. IWO Mateusz Hoeft - wikary domu, i wikariusz Parafii
o. JONASZ Jan Krefta - spowiednik
o. DEZYDERIUSZ Kazimierz Głodowski - spowiednik
o. JĘDRZEJ Krystian Lietzau - spowiednik
o. BOŻYSŁAW Waldemar Timoszyk - spowiednik
o. FRANCISZEK Krzysztof Chodkowski - zastępca Prowincjała, dyrektor Domu Pielgrzyma
br. BOGUMIŁ Paweł Dudziński - furtian, ekonom
o. PAWEŁ Wojciech Popów - zastępca dyrektora Domu Pielgrzyma, duszpasterz pielgrzymów